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2020年6月28日 (日)

ヒトゲノムは32億5400万塩基対?

2014/05/19に『くらえ ヒトゲノム塩基配列』…ヒトゲノムは30億塩基対じゃなくて、31億塩基対なのか~という記事を書いたのですが、
『ウニ学』という本を読んでいたら「ヒトゲノムは32億5400万塩基対」と書かれていた。

この本は2009年3月5日 第1版第1刷発行
31億塩基対なのか~と書いた2014年より前だ。
ヒトゲノム計画は『2003年4月14日には完成版が公開された。』ので、この時点でヒトゲノム塩基対の数は確定してるよね。その数値はどこに出ているのでしょう? ちょっと検索したけど見つけられない(^^;
ヒトゲノムは 30億、31億、32億 どれなのか?
「ヒトゲノム 30億」で検索… 約 202,000 件
「ヒトゲノム 31億」で検索… 約 113,000 件
「ヒトゲノム 32億」で検索… 約 116,000 件
ん~ 31億と32億はほぼ同数。30億はいまだに多い。
ヒトゲノム計画以前は「ヒトゲノムは30億塩基対」と言われていたけど、
ヒトゲノム計画完了(2003年)から17年も経つんだから、そろそろ正確な数値が広まっててもいいんじゃないの? と思うんだけど、いまだに正確な数値が浸透しないのですね~
ところで、正確な数値って「32億5400万塩基対」なの?
「ヒトゲノム 32億5400万」で検索…約 33,700 件
一家に1枚ヒトゲノムマップ|京都大学の[PDF]にその数値があるようなのだが、PDF内を「32億」で検索しても見つからない。(^^;
ゲノムとは|地球資源論研究室に「32億5400万」とある。
このデータは、京都大学大学院生命科学研究科(HP/2012/4)による『Genome Mapヒトゲノムマップ』から抜粋 で、23本の染色体ごとの塩基対数の表があり、計 32億5400万 となっている。

あ~!
X染色体 1億6300万塩基対
Y染色体 5100万塩基対となってる。
性染色体の大きさってこんなに違うんだ~!
Y染色体消滅説」というのがあったけど・・・「男性は絶滅」しないようです(^^;

それより、「32億5400万塩基対」というのは、X Y 染色体の塩基対数をどちらも加えた値です。
でも、Y染色体で性の決定に関わる遺伝子はごく少数で、他はX染色体と同相の遺伝子なんでしょ?
すると、Y染色体の塩基対数も加えたらダブルカウントになってるよね。
「32億5400万塩基対」からY染色体の「5100万塩基対」を引くと、「32億300万塩基対」となる。
ん、ならば「ヒトゲノムは約32億塩基対」と表現するのが妥当ですね。


『ウニ学』のP.373~『ウニのゲノムサイズと遺伝子数』に興味深いデータがありました。
ヒトゲノム:32億5400万塩基対
ハエのゲノム:1億1800万塩基対
ウニのゲノム:8億1400万塩基対
ウニはヒトの約1/4、ハエの7倍の大きさのゲノムを持つ
では、遺伝子数はどうだろうか?
遺伝子予測研究によると、
ウニの遺伝子数:2万3300
ヒトの遺伝子数:2万~3万
ハエの遺伝子数:1万7000
つまり、ウニ、ヒト、ハエの遺伝子数に大差はない。ゲノムのサイズがだいぶ違うのに遺伝子数は似たようなものである理由はよくわかっていない。

※「遺伝子予測研究」とは?⇒「遺伝子予測研究」で検索
※人の遺伝子数は 2万6808 という値が「ゲノムとは」のページにありました。
「ヒト遺伝子数」で検索したら…
人間の遺伝子数 最新で2万1306個: 日本経済新聞(2018/9/23)
『2003年に国際協力でヒトゲノム(人間の全遺伝情報)の解読作業を完了したが、いまだに遺伝子数は確定していない。今後の研究によってまだ変化する可能性がある。』そうです。



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